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廣大的山林目前由政府所管，但是應該要由現在農委會林務局主管還是由環境部來管理? 環保團體認為，山林的保育應該交由環境部管理，完全以環保的立場為出發點來看待台灣的山林，不過，有國民黨原住民籍的立委鄭天財認為，廣大的山林應該留給農業部來管，鄭天財就提案要求把林務局、林試所等業務在政府組織改造之後保留在農業部裡面，這與環保團體的立場大相逕庭，不過，現在這個提案已經進入朝野協商的階段，已經無法如環保團體的期待撤案，1月8日環保團體親自前往鄭天財辦公室再了解有沒有轉圜的空間。
地球公民基金會就認為，政府不能把林業當作農業來經營，林務業務應該要編制在環境資源部內，由政府整合、管理與保護，以免被過度買賣開發利用，不過，鄭天財認為，提案的目的指未有效管理林地，經過大約2個小時的會談，雙方互相了解對方的立場，鄭天財鬆口表示，他並不堅持一定要將林務業務留在農業部，而是應該有效管理經營林務業務。
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